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    发表日期:2006年8月12日 编辑:cnpsy 有3886位读者读过此文 【字体:
第十四章 活着--Survival菜单详解(下)

§13.3    Cox Regression过程

上面给大家介绍的是两种生存分析方法,但它们只能研究一至两个因素对生存时间的影响,当对生存时间的影响因素有多个时,它们就无能为力了,下面我给大家介绍Cox Regression过程,这是一种专门用于生存时间的多变量分析的统计方法。

Cox Regression过程主要用于:

1、 用以描述多个变量对生存时间的影响。此时可控制一个或几个因素,考察其他因素对生存时间的影响,及各因素之间的交互作用。

例13.3 40名肺癌患者的生存资料(详见胡克震主编的《医学随访统计方法》199377页)

生存时间

状态

生活能力评分

年龄

诊断到研究时间

鳞癌

小细胞癌

腺癌

疗法

癌症类别

411

1

70

64

5

1

0

0

1

1.00

126

1

60

63

9

1

0

0

1

1.00

118

1

70

65

11

1

0

0

1

1.00

注:原数据库是用亚变量定义肺癌分类:000为其它癌;100为鳞癌;010为小细胞癌;001为腺癌。表中的最后一个变量是我加上去的癌症类别,1为鳞癌;2为小细胞癌;3为腺癌;4为其它癌。实践表明结果与用亚变量计算一样。

13.3.1    界面说明

图9    Cox回归主对话框

Time】框、【Status】框前文已经介绍过了,这里我就不再废话唠叨的了。Block 1 of 1右边的Next钮被激活。这个按钮用于确定不同自变量进入回归方程的方法,详见Method框的内容。用同一种方法进入回归方程的自变量在同一个Covariates框内。

Covariates】框

选入自/协变量,即选入你认为可能对生存时间有影响的变量。

Method】框

选择自变量进入Cox回归方程的方法,SPSS提供下面几种方法:

  • Enter: Covariates框内的全部变量均进入回归模型。

  •  Forward: Conditional: 基于条件参数估计的向前法。

  • Forward: LR: 基于偏最大似然估计的向前法。

  •  Forward: Wald: 基于Wald统计量的向前法。

  •  Backward: Conditional: 基于条件参数估计的后退法。

  •  Backward: LR: 基于偏最大似然估计的后退法。

  •  Backward: Wald: 基于Wald统计量的后退法。

Strata】框

定义分层因素,将生存时间按分层因素分别进行Cox回归。

Categorical】选项

用于告诉系统,Covariates框内的变量中哪些是分类变量或字符型变量。系统默认字符型变量为分类变量,数字型变量为连续型变量。

选入自变量后,categorical钮被激活。按categorical钮,进入确定分类变量的对话框。见图10。

图10   确定分类变量对话框

左边的Covariates框中列出了刚刚被选取的自变量,将分类变量选入Categorical Covariates框中。此时Change Contrast框被激活,请你选择比较方法,即计算参数OR/βi的方法。当选入分类变量后,Change Contrast框被激活,此时可选择比较方法。SPSS提供下面几种比较方法。

  • Indicator:指示对比。用于指定某一分类变量的基线,即参照水平。这样计算出来的参数OR/βi是以该变量的第一个或最后一个水平为基准水平(取决于下面的reference category中你选择的是last还是first)。在这里SPSS自动创建亚变量,对照水平在对比分类矩阵中用0行代表。在这里我再多说两句,如本例中的肿瘤类型,若规定鳞癌为1,小细胞癌为2,腺癌为3,其它癌为4。若选indicator及last,则以其它癌为参照,计算出来的OR及βi是以其它癌为基准,即其它癌的OR为1,其他计算出来的OR值是与其它癌相比的结果。

  • Simple:差别对比。可计算该分类变量的各水平与参照水平相比的OR值。参照水平自己当然就不用跟自己相比了。对于本例来说,Simple与Indicator选项是一样的,前提是下面的Reference Category中你所选择的同是last(或first)。

  • Difference:差别对比。分类变量欲比较水平与其前面的各水平平均值进行比较,当然也不包括第一水平。与Helmert法相反,因此也叫反Helmert法。如3水平与12水平的平均值相比,下同。

  •  Helmert:赫尔默特对比。分类变量欲比较水平与其后面各水平平均值进行比较,当然不包括最后一个水平。

  •  Repeated:重复对比。分类变量的各水平与其前面相邻的水平相比较(第一水平除外)。

  •  Polynomial:多项式对比。仅用于数字型的分类变量。无效假设是假设各水平是等距离的(可以是线性的关系,也可以是立方、四次方的关系)。例如年龄每增加10岁,死亡风险的增加值是一样的,但实际情况常常与此相反,如在20岁与60岁年龄段,年龄都增加10岁,所增加的死亡风险肯定是不一样的,具体情况需根据各人的研究课题,专业而定。

  •  Deviation:离差对比。除了所规定的参照水平外,其余每个水平均与总体水平相比。

  • Reference category:如果你选择了Deviation, Simple, Indicator三个选项,就必须选择FirstLast作为参照水平。

完成上述选择后,击change钮,确认选择。

你若对上面写的一段感兴趣的话,可跳过去,直接用系统默认的选项。

Plots】选项

11              Cox回归统计图对话框

       Survival:累积生存函数曲线。

       Hazard:累积风险函数曲线。

       Log minus log:对数累积生存函数乘以-1后再取对数。

       One minus survival:生存函数被1减后的曲线。

  •  Change Value:系统默认用各变量的均数进行作图,但对字符型变量如癌症类型取均值则没有实际意义。若用分类变量的其它水平进行作图,则选定该变量,此时Change Value钮被激活,按Value钮,在其右边的框内输入你所想要用于作图的值。击Change

  •  Separate Line for:输入分类变量的名称,此时可以用分类变量的不同水平进行作图,对于本例则可作出不同癌症的曲线。此分类变量必须包括在前面的自变量框中。

Save存为新变量

12      Cox回归存为新变量对话框

l         Survival:生存函数。

 Function:累积生存函数估计值。

 Standard error:累积生存函数估计值的标准误。

 Log minus log:对数累积生存函数乘以-1后再取对数。

l         Diagnostics:回归诊断。

 Hazard function Cox-Snell:残差。

 Partial residual:偏残差。

 Dfbeta(s):剔除某一观察单位后的回归系数变化量。

 X*Beta:线性预测得分。

Options】选项

Options按钮,弹出选项对话框。

13   Cox回归选项对话框

l         Model Statistics:模型统计量。

 CI for exp(ß) 95%:相对危险度的可信区间。系统默认95%可信区间。

 Correlation of estimates:回归系数的相关阵。

l         Display model:输出模型方式。

l         At each step:输出每一步的模型。系统默认。

l         At last step:输出最后一步的模型。

l         Probability for Stepwise:模型保留变量的显著性水平。

 Entry系统默认选入变量为P≤0.05。

 Removal系统默认剔除变量为P>0.10。

 Maximum Iterations:最大迭代次数,系统默认20次。

 Display baseline function:输出风险基准函数以及基于各协变量均值的生存函数与风险函数。

操作如下:

1.       Analyze==>Survival ==>Cox regression

2.       Time框:选入survival time

3.       Status框:选入status;击define events钮,在single value框右边的空格中输入1;

4.       Covariate框:选入x1,x2,x3,x7,x8;

5.       Categorical列表框:选入x8;

6.       Plots 列表框:

l         Plot Type:选survival;

l         Separate Line for:选入x8;

7.       Option列表框:

l         Model Statistics:

 CI for exp(ß):输出回归系数ß的95%可信区间。

 选Correlation of estimate:输出自变量的相关矩阵。

单击OK钮

13.3.2 结果解释:

Cox Regression

上表输出总例数、删失例数、失访例数。

输出各种癌症的频数及系统所赋的亚变量x81、x82、x83值,当癌症类型是鳞癌时,x81取值为1,其它亚变量取值为0,依此类推。

Block 0: Beginning Block

模型拟合迭代过程,可不管它。

Block1: Method = Enter

描述模型参数(常数项除外)是否全为0,本例,χ2=30.120,自由度υ=7,P=0.000。说明βI不全为0。

对回归方程各参数的估计,B即ß值;SE,标准误;Wald,Wald卡方;df,自由度;sig,自由度;exp(B),OR值;95%Ci for EXP(B),OR值的95%可信区间。

自变量的相关矩阵。本例,X1与X2的相关系数是0.072,其它依此类推。

输出自变量的均数及其在不同模式下的取值,因X1,X2,X3,X7四个变量没有生成亚变量,故在此输出它们的均数。

输出在各自变量的均值水平时的累积生存函数曲线。

输出各种癌症的累积生存函数曲线。



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